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基因測序里還有哪些技術(shù)“劫”?

2016-06-15 16:06 來源:科技日報 責任編輯:fl
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摘要:日前,一些從事醫(yī)療投資和基因組醫(yī)學研究的學者在艾瑞咨詢主辦的“基因測序賽道掃描沙龍”上探討產(chǎn)業(yè)發(fā)展上的技術(shù)“劫”,希望明晰產(chǎn)業(yè)發(fā)展“路線

日前,一些從事醫(yī)療投資和基因組醫(yī)學研究的學者在艾瑞咨詢主辦的“基因測序賽道掃描沙龍”上探討產(chǎn)業(yè)發(fā)展上的技術(shù)“劫”,希望明晰產(chǎn)業(yè)發(fā)展“路線圖”。

2016年3月,在科技部發(fā)布的重點專項申報指南的相關(guān)通知中,將“精準醫(yī)學研究”列為2016年優(yōu)先啟動的重點專項之一,支持以基因測序為基礎(chǔ)的精準醫(yī)療行業(yè)。

從2014年衛(wèi)計委對基因測序的臨床短暫叫停,到當年發(fā)布試點名單,政策的重啟,開動了我國基因測序產(chǎn)業(yè)“開往春天的列車”。

試點一年多以來,相關(guān)行業(yè)、企業(yè)和研究單位紛紛找到方向,快速啟動相關(guān)儀器、試劑、軟件的注冊工作,并帶動了研究聚焦和資本聚集。

讀懂“二級密碼”,才能和“病”搭上線

從研究到臨床,原來最大的障礙——錢的問題解決了,還有什么“劫”?

與2001年人類基因組草圖發(fā)表時相比,基因測序成本降至“萬分之一”,然而臨床應用卻沒有成倍增加。

事實上,“測序”只完成了生命體“一級密碼”的解讀,要讓它和疾病關(guān)聯(lián)起來,還需要“解密”基因突變帶來了哪些疾病,將“基因片段”和“疾病發(fā)生”匹配起來,完成“二級密碼”的破譯。

中科院北京基因組研究所博士生導師方向東將臨床應用的實現(xiàn)歸結(jié)為3個要素:隊列以及樣本庫是基礎(chǔ)、可實現(xiàn)醫(yī)學干預是核心、數(shù)據(jù)集成與分析是關(guān)鍵。

因此,單獨的基因測序數(shù)據(jù)并不能指導臨床治療,要習得“二級密碼本”需要建立樣本庫、積累多維度數(shù)據(jù)并進行分析,一層層剝開“生命密碼”,指導臨床治療。

“是基因數(shù)據(jù)和多維度數(shù)據(jù)的解讀能力,將基因測序技術(shù)推向臨床診斷和治療。”方向東說。

然而,目前基因數(shù)據(jù)分析和解讀能力仍然能力不足,基因數(shù)據(jù)的解讀很大程度還停留在基因水平,而不是精確的基因突變水平,同時基因數(shù)據(jù)還不能同病患生理體征、生活習慣檢測和微觀環(huán)境等多維度數(shù)據(jù)進行綜合分析。

投資圈“在預熱”,設(shè)備國產(chǎn)化不能成為“軟肋”

“說實在的,能夠投資的公司只有百分之十幾。”談到在基因測序行業(yè)進行投融資的經(jīng)歷,君聯(lián)資本總經(jīng)理蔡大慶說,投資者應該明確要注資的是基礎(chǔ)研究,還是能夠商業(yè)化的研究?

“有很多投資,投的是科研院所要進行的研究。”他認為目前的投資模式存在錯位現(xiàn)象,一大批投資投向各種各樣的研究,創(chuàng)業(yè)團隊從事的卻可能不是領(lǐng)域里所缺的,好的商業(yè)環(huán)境應該是“多家科研機構(gòu)共同出資支持基礎(chǔ)研究,到一定程度后,由商業(yè)機構(gòu)接過去,再用到病人身上”。

不僅投資沒有形成合力,基因測序行業(yè)在互聯(lián)網(wǎng)醫(yī)療里也算“冷門”。據(jù)艾瑞發(fā)布的《全球二代基因測序行業(yè)投研報告》顯示,互聯(lián)網(wǎng)醫(yī)療行業(yè)在2015年共獲得141筆投資,金額15.1億美元,其中我國基因測序行業(yè)僅獲得16筆投資,金額為0.7億美元,約為互聯(lián)網(wǎng)醫(yī)療行業(yè)的1/20。調(diào)查顯示,這是緣于我國基因測序行業(yè)上游設(shè)備制造嚴重依賴進口、且有現(xiàn)行可替代檢測方法、醫(yī)療實際需求沒有大量形成。

關(guān)于設(shè)備的國產(chǎn)化,方向東認為雖然起步晚,但正在大步緊追,“華大基因發(fā)布了具有完全自主知識產(chǎn)權(quán)的基因組數(shù)據(jù)分析云計算平臺BGI系統(tǒng),華音康公司已生產(chǎn)出國產(chǎn)高通量測序系統(tǒng),中科紫鑫開發(fā)的Pad測序設(shè)備幾個小時內(nèi)完成測序、便攜小巧、適合臨床,剛剛獲得了國家六千萬的儀器專項資助。”

Pad測序可能幫助國產(chǎn)設(shè)備實現(xiàn)“彎道超車”,“如果掌上設(shè)備就能完成測序,那將帶來結(jié)構(gòu)性變化。”艾瑞研究院院長曹軍波表示,硬件的便攜性促成了互聯(lián)網(wǎng)的發(fā)展,同樣可以把基因測序“嫁”到各個產(chǎn)業(yè)上,“掌上設(shè)備讓海量數(shù)據(jù)更易被采集,分析的樣本庫也將更龐大,后續(xù)撬動的市場規(guī)模將極其龐大。”

“大數(shù)據(jù)”官方整合,多角度接入撬動市場

樣本庫是基因測序邁進臨床的“基礎(chǔ)”。30年來,超過20萬人的生物樣本庫在江蘇泰州建立起來,60余萬例食管癌的數(shù)據(jù)及400例以上食管癌完整的基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組數(shù)據(jù)也經(jīng)過數(shù)年建立起來……

    這些分散的數(shù)據(jù)庫需要進一步整合。方向東表示,“臨床數(shù)據(jù)分析時,必須要有一個權(quán)威的數(shù)據(jù)倉儲??萍疾壳澳暌褑恿讼嚓P(guān)項目,投資數(shù)億元做數(shù)據(jù)整合工作。”

 

“這個行業(yè)的未來走勢是什么樣,會不會跟互聯(lián)網(wǎng)領(lǐng)域趨同?”曹軍波回答得很肯定:“的確呈現(xiàn)類似的特征。十幾年內(nèi),測序技術(shù)不斷變革,測序成本不斷下降,這與科技創(chuàng)新的行業(yè)特征相吻合,如果有多方面的產(chǎn)業(yè)鏈進入,市場空間可以快速打開。”

目前的基因測序應用領(lǐng)域包括遺傳病診斷、腫瘤診斷與治療、生物多樣性保護等醫(yī)療和非醫(yī)療領(lǐng)域。

“基因測序能支撐起背后更大產(chǎn)業(yè)鏈。”曹軍波說,與“互聯(lián)網(wǎng)+”相似,目前,很多投資方和企業(yè)所看重的,并不僅僅是基因測序本身,而是基于它能夠撬動的其他相關(guān)市場。也就是說,技術(shù)和市場布局逐步完善的基礎(chǔ)上,“基因+”也將變革諸多產(chǎn)業(yè)領(lǐng)域。(張佳星)

 

 

責任編輯:fl

(原標題:科技日報 )

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